ISSN 1812-3368. Вестник МГТУ им. Н.Э. Баумана. Сер. «Естественные науки». 2012
165
С формальной точки зрения, согласно характеристическому спек-
тру (рис. 4,
г
)
и спектру отклонения от 14-профильности (рис. 4,
е
),
во
второй подпоследовательности выявляется скрытый период в
14
нукл. Однако характеристический спектр (см. рис. 4,
г
)
и спектр
отклонения от 7-профильности (см. рис. 4,
д
)
указывают на наличие в
ней 7-профильной периодичности, т. е. тестируемого периода в
14
нукл., являющегося обертоном периода в 7 нукл.
На рис. 4,
ж
—
и
приведены также и профильные матрицы случай-
ных паттернов периодичности для трех анализируемых производных
подпоследовательностей. Критерий Пирсона показывает статистиче-
ское отличие случайных букв
В
1
и
В
3
паттернов периодичности для
первой и третьей производных подпоследовательностей.
Для второй подпоследовательности статистическая обработка ее
профильной матрицы (рис. 4,
и
),
графически представленной на
рис. 4,
к
,
позволяет представить случайный паттерн периодичности
этой последовательности в виде строки случайных букв:
1 2 3 4 5 2 2
C C C C C C C
.
Значит, случайный паттерн периодичности полной
анализируемой CDS имеет алфавит из семи случайных букв и состо-
ит из 21 случайной буквы. Таким образом, декомпозиция завершена.
Декомпозиция CDS гена аполипопротеина
E
человека дает сле-
дующие результаты. Согласно спектрально-статистическому подхо-
ду, в этой последовательности наблюдается скрытая 33-профиль-
ность (рис. 5).
Рис. 5. Спектры
D
L
отклонения от
L
-
профильности для тестируемого периода
λ
при
L
= 1 (
а
), 3 (
в
), 33 (
г
)
и характеристический спектр
Н
(
б
)
кодирующего
района гена аполипопротеина
E
(
KEGG, hsa:348, 954 нукл.)