ISSN 1812-3368. Вестник МГТУ им. Н.Э. Баумана. Сер. «Естественные науки». 2012
167
Рис. 7. Матрицы паттернов 11-периодичности по первой (
а
)
и второй (
б
)
пози-
циям триплетов в гене аполипопротеина
E
(
KEGG, hsa:348, 954 нукл.), визуа-
лизация матрицы паттерна по первой (
в
)
и второй (
г
)
позициям
В рамках рассматриваемой работы предложены методы декомпо-
зиции паттернов скрытой периодичности в CDS ДНК. В основе де-
композиции лежит анализ наблюдаемой в таких последовательностях
3-
регулярности, обусловленной генетическим триплетным кодом.
Явление 3-регулярности позволило значительно упростить процесс
декомпозиции. С помощью такой декомпозиции возможно в не-
сколько раз сократить размер алфавита случайного паттерна скрытой
профильной периодичности, что было продемонстрировано на ряде
примеров из генома человека.