ISSN 1812-3368. Вестник МГТУ им. Н.Э. Баумана. Сер. «Естественные науки». 2012
146
УДК 577.2:519.23
В. А. К у т ы р к и н, М. Б. Ч а л е й
СТРУКТУРНЫЕ РАЗЛИЧИЯ КОДИРУЮЩИХ
И НЕКОДИРУЮЩИХ РАЙОНОВ
ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ ДНК ГЕНОМА
ЧЕЛОВЕКА
Проведен количественный анализ регулярных структурных
свойств кодирующих и некодирующих районов последовательно-
стей генома человека. На его основе предложен эффективный
статистический критерий
,
позволяющий распознавать кодирую-
щие районы последовательности ДНК генома человека. В них вы-
явлена двухуровневая организация кодирования генетической ин-
формации.
E-mail:
vkutyrkin@yandex.ru,
maramaria@yandex.ru
Ключевые слова
:
скрытая периодичность, скрытая профильность,
спектрально-статистический подход, распознавание кодирующих рай-
онов ДНК.
Современные технологии секвенирования геномов различных ор-
ганизмов позволили представить полимерные молекулы ДНК в виде
текстовых строк в алфавите из четырех букв (A, T, G, C), соответству-
ющих четырем типам мономерных звеньев ДНК – четырем нуклеоти-
дам (нукл.). В этих текстовых строках содержится основная информа-
ция о наследуемых свойствах организмов. Скорость накопления таких
генетических данных значительно обгоняет экспериментальные и тео-
ретические возможности анализа заключенной в них информации.
В текстовых последовательностях ДНК находятся так называемые ко-
дирующие районы, транслируемые в соответствующие последова-
тельности белков. Как известно, белки образуют структурно-функци-
ональную основу всех живых организмов. Выявление кодирующих
районов является одной из актуальных проблем генетического анализа
последовательностей ДНК. Для ее решения используют методы, обла-
дающие различной степенью достоверности. В результате в базах дан-
ных накапливается большой объем последовательностей, относимых к
потенциально кодирующим районам и ожидающих в дальнейшем под-
тверждения достоверности. Поэтому разработка новых эффективных
методов выявления кодирующих районов является важной практиче-
ской задачей. Для создания таких методов необходимо решить про-
МОДЕЛИРОВАНИЕ В БИОЛОГИИ